خصصت أولى قاعات المتحف لتعريف الزائر بعلم الآثار وطرق التنقيب والمعدات المستخدمة في ذلك. وعلقت على الجدران بعض القطع الأثرية المكبرة عن القطع الأصلية، كي يتسنى للزائر التعرف عليها وتفحص معالمها. أما القاعات الأخرى التي تم تجهيزها بأحدث تكنولوجيا الإضاءة والعرض فتقدم معروضات مهمة عن المراحل التي مرت بها المنطقة وسكانها وملامح الحياة الاجتماعية والمعتقدات الدينية وطقوس الموت ونمط المعيشة والمبادلات التجارية. ومن أهم معروضات المتحف تلك القطع المهداة من صاحب السمو حاكم الشارقة، الذي قام بشرائها وإعادتها إلى مكانها الأصلي في الشارقة.